Золотые слова, коллега!

Какую проблему? Если проблема с клавиатурой, то это в основном наблюдается на Win8.
DX12 лучше не включать, как-то криво он в этой игре реализован. С DX11 фпс будет и выше, и игра будет более лучше работать.
Визуальной разницы между DX11 и DX12 нет.

Потому что настройки игры сохраняются в корневой папке установленной игры. В частности, в файлике re2_config.ini
Сейвы лежат по пути:
%SystemDrive%UsersPublicDocumentsSteamCODEX883710
Там уже деактивирован атрибут "Только для чтения".

Попробуй просто закинуть мою сохранку, где уже пройден этот этап первоначальной настройки игры, что вызывает проблему с клавиатурой.
http://file.sampo.ru/g7q365/
Распакуй данную папку и закинь её по пути: %SystemDrive%UsersPublicDocumentsSteamCODEX
В общем, просто скопируй этот путь и вбей в поиск (Win+S).
Потом уже в игре нажмёшь "Новую игру".

Всегда нужно отключать торрент-клиент во время установки игр, чтобы не возникало ошибок при распаковке. Ну и проверить, чтобы в Windows был включен файл подкачки.
Если не сохраняются настройки, нужно из контекстного меню, по правому клику мыши на папке установленной игры, в свойствах убрать галку напротив атрибута "Только для чтения".

У кого чёрный экран нужно в биосе отлючить Intel® Virtualization Technology (Intel® VT).
Причём, эта проблема наблюдается только на процах от Intel. У меня проц от АМD, c включенной виртуализацией, то никаких проблем не вызывает.

Лучше играть с DX11. Визуально DX12 никаких новшеств не даёт. Ну, кроме пресловутого рейтресинга в RTX. Да и то, в этой игре рейтресинг не предусмотрен. Этот АPI был придуман Майкрософт, как ответ той же Mantle или Vulkan, т.е. для низкоуровневой оптимизации работы игр. Но в этой игре DX12, напротив, ещё больше просаживает частоту кадров по сравнению с DX11. То ли такая кривая реализация на уровне движка игры, то ли на уровне видеодрайвера. В общем, с DX11 фпс прибавится ещё больше, при этом картинка будет та же.
Чего не скажешь о той же Ларе та, что Крофт, где DX12 всё же существенно прибавляет фпс по сравнению с DX11.

Соглашусь с коллегой выше, никаких лагов нет. Игра изумительным образом работает!
Ryzen 1300X, 16GB DDR4, GTX1060 (6Gb).
Версия видеодрайвера: 417.35. Windows 10 LTSB.
Играю с джойстиком, в FullHD 60Гц, c вертикальной синхронизацией. Всё плавно, красиво, и стабильно.

Ух ты! Очень похожа на шикарную игру Trine.

Разобрался с работой геймпада!
Для игры Prеy версии 1.05 нужно на сайте нексуса, в разделе "Оld files", скачать XInput Fix версии 0.4:
https://www.nexusmods.com/prey2017/mods/19?tab=files
Файлик распаковываем из архива и закидываем в папку с игрой, где находится экзешник.